Σε ημερήσια διάταξη οι έφηβοι και νεαροί ενήλικες συμμετέχουν σε  ατομικά και ομαδικά προγράμματα, που περιλαμβάνουν συνεδρίες εξατομικευμένης θεραπευτικής αποκατάστασης, λογοθεραπείας, εργοθεραπείας και προσαρμοσμένης φυσικής αγωγής. Κάθε ένα από τα προγράμματα διαμορφώνεται στη βάση των ιδιαίτερων αναγκών κάθε ατόμου, προσαρμόζεται στα ενδιαφέροντα και εναρμονίζεται με την προσωπικότητα του. Κεντρικό στόχο των προγραμμάτων αποτελεί η ενίσχυση των ικανοτήτων των εξυπηρετούμενων για την προώθηση της αυτονομίας τους καθώς και η συνακόλουθη άμβλυνση των δυσκολιών που συναντούν στην καθημερινότητά τους.

Στον τομέα της αυτονομίας συμβάλλουν, επίσης, τα προγράμματα δραστηριοτήτων καθημερινής ζωής όπου οι εξυπηρετούμενοι εμπλέκονται σε ασχολίες που αφορούν την αυτοεξυπηρέτησή τους (π.χ. παρασκευή και προετοιμασία του κολατσιού τους) και τη συμμετοχή τους σε εργασίες που προσομοιώνουν τη λειτουργία ενός σπιτιού (π.χ. στρώσιμο τραπεζιού / ξεσκόνισμα / φροντίδα του κήπου κ.α.).

Επιπλέον, τα εξωτερικά προγράμματα (εκδρομές, περίπατοι στο πάρκο, αγορές σε καταστήματα – λαϊκή/σούπερ μάρκετ κ.α.) αποτελούν σταθερό μέρος του ημερήσιου προγράμματος, καθώς μέσα από την εμπλοκή των ωφελούμενων σε δραστηριότητες, που τους επιτρέπουν την επαφή με την κοινότητα, αναπτύσσουν τις κοινωνικές τους δεξιότητες, ενδυναμώνονται σε επίπεδο αυτονομίας και καταπολεμούν το στίγμα μέσα από μία σταθερή διάδραση με τη γειτονιά διαλύοντας τον φόβο, την περιέργεια και την προκατάληψη που συνοδεύει την άγνοια για τον αυτισμό.

Παράλληλα, στόχος του Κ.Η. είναι η διατήρηση της επαφής και της επικοινωνίας με το οικογενειακό δίκτυο κάθε ατόμου. Για τους σκοπούς αυτούς παρέχεται συμβουλευτική γονέων. Ουσιαστικά, πρόκειται για μηνιαίες συναντήσεις όπου οι γονείς/κηδεμόνες έχουν τη δυνατότητα να μοιραστούν σκέψεις, προβληματισμούς, ανησυχίες, να συζητήσουν για τις ανάγκες τους και να επικοινωνήσουν τα αιτήματά τους αναφορικά με την παρουσία του εφήβου/νεαρού ενήλικα στη δομή. Επιπρόσθετα, δίνεται  μία συνολική εικόνα της ζωής του ωφελούμενου τόσο στο σπίτι όσο και στο Κ.Η., σε μια γόνιμη ανταλλαγή πληροφοριών με τον επιστημονικά υπεύθυνο της δομής και τον υπεύθυνο θεραπευτή του κάθε εξυπηρετούμενου.

Η δυνατότητα άμεσης επικοινωνίας ανάμεσα στους θεραπευτές και την οικογένεια δίνει την ευκαιρία να μεταφερθούν κατεκτημένοι στόχοι από το πλαίσιο του Κ.Η. στην καθημερινότητα της οικογένειας, ενισχύοντας την αυτονομία του εξυπηρετούμενου και τη δράση του στην οικογένεια ως ισότιμου και ενεργού μέλους.

Υποστηρικτικά για τη βελτίωση της ποιότητας ζωής στο σπίτι λειτουργεί και το πιλοτικό πρόγραμμα των κατ’ οίκον επισκέψεων που λαμβάνει χώρα δύο φορές τον μήνα. Στόχος του προγράμματος είναι η ψυχοεκπαίδευση και η ενδυνάμωση της οικογένειας στη βάση συγκεκριμένων αιτημάτων που φέρνει η ίδια και αφορούν τη ζωή στο σπίτι.